Perjantaina 7.4. klo 12:00, Ylistönrinne YAA 303
FM Roghaieh Ashrafin ekologian ja evoluutiobiologian väitöskirjan ”Exploring potential evolutionary responses to increasing temperature in an environmental opportunistic pathogen” tarkastustilaisuus. Vastaväittäjänä professori Anna-Liisa Laine (Helsingin yliopisto) ja kustoksena dosentti Tarmo Ketola (Jyväskylän yliopisto). Väitöstilaisuus on englanninkielinen.
Elämme keskellä voimakasta ympäristömuutosta, jossa maapallon keskilämpötila nousee ja lämpötilojen vaihtelut lisääntyvät dramaattisesti ihmisten toiminnan seurauksena. Lämpötilojen vaihtelut vaikuttavat voimakkaasti muun muassa eliöihin, joiden kasvua ja selviytymistä lämpötilat säätelevät.
Roghaieh Ashrafi tutki väitöskirjassaan Flavobacterium columnare –bakteerin populaatiogenetiikkaa, lajin sisäistä kilpailua ja lämpötilansietoa. Bakteeri aiheuttaa merkittäviä taloudellisia tappioita kalanviljelyssä ympäri maapalloa. Koska bakteeri kykenee elämään sekä kalassa että sen ulkopuolella, lämpötila voi vaikuttaa tämän opportunistibakteerin taudinaiheutuskykyyn ja sen evoluutioon.
Tutkimusaineistona toimivat 83 bakteerikantaa, jotka oli eristetty vedestä tai sairastuneista kaloista eri puolilta Suomea vuosina 2003–2012. Kuuden muuntelua sisältävän geenin sekvenssejä vertailemalla saatiin selville, kuinka bakteerikannat jakautuvat geneettisesti kahteen päälinjaan ja viiteen eri perimätyyppiin. Bakteerin eristämisajankohta, -paikka tai kalalaji ei vaikuttanut perimätyypin esiintymiseen. Perimien välillä oli kuitenkin merkittäviä eroja lämmönsietokyvyssä.
Lämpötilansietokyky kehittyy muiden ominaisuuksien kustannuksella
Tutkimuksessa kävi ilmi Pohjois-Suomesta eristettyjen bakteerikantojen kylmänsietokyvyn olevan Etelä-Suomesta löytyvien kantojen sietokykyä parempi. Vaikka yleisesti kantojen taudinaiheutuskyky on kasvanut vuosien saatossa, Ashrafi havaitsi hyvän lämpötilansietokyvyn olevan yhteydessä myös alhaisempaan taudinaiheutuskykyyn.
Bakteerin lajinsisäisen kilpailun tutkimiseksi väittelijä kehitti menetelmän, jolla pystytään seuraamaan hankalasti toisistaan erotettavien kantojen kasvua. Uusi menetelmä perustuu trpB-geenin sekvenssissä olevien pienien erojen havaitsemiseen. Lajin sisäinen kilpailu voi sekoittaa lämpötilan aiheuttamaa valintaa ympäristössä, jos hyvin lämpöä sietävä bakteerikanta onkin huono sietämään kilpailua.
Tutkimustulosten perusteella voidaan päätellä lämpötilan vaikuttavan voimakkaasti kilpailuun riippuen siitä, tapahtuuko valinta pinnoilla vai nesteessä. Kasvumittauksilla tai kilpailutesteillä ei voida aukottomasti selvittää, mikä kannoista pärjää missäkin kilpailutilanteessa. Ashrafin tutkimuksen perusteella lämpötila vaikuttaa Flavobacterium columnare –bakteerin kantojen väliseen kilpailuun, evoluutioon ja kantojen esiintymiseen. Lämpötila ei kuitenkaan yksin selitä muutoksia taudinaiheutuskyvyssä. Epidemioiden lisääntyminen voikin selittyä pidentyneellä kasvukaudella sekä muilla kalanviljely-ympäristössä vaikuttavilla valintatekijöillä.
Lisätietoja:
Roghaieh Ashrafi, puh. 040 824 2290, [email protected]
Viestintäharjoittelija Kirke Hassinen, 040 805 3638, [email protected]
Ashrafi valmistui luonnontieteiden kandidaatiksi kasvitieteen alalta Iranin Urmia yliopistosta. Hän jatkoi bio- ja ympäristötieteiden laitoksella maisteriohjelmassa Jyväskylän yliopistossa, ja valmistui maisteriksi vuonna 2012. Ashrafin väitöstutkimuksen pääohjaajana toimi dosentti Tarmo Ketola, muita ohjaajia olivat dosentti Katja Pulkkinen ja akatemiatutkija Lotta-Riina Sundberg.
Teos on julkaistu sarjassa Jyväskylä studies in biological and environmental science, 328, 45 s., ISSN 1456-9701, ISBN 978-951-39-7006-2 (nid.), ISBN 978-951-39-7007-9 (PDF). Pysyvä linkki julkaisuun: http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-39-7007-9
Jyväskylän yliopisto on yksi maamme suosituimmista ja tuloksellisimmista yliopistoista. Painoalamme ovat oppiminen ja opetus, luonnontieteet, kielet ja kulttuuri, liikunta ja informaatioteknologia. Olemme johtava koulutuksen asiantuntija, opettajankouluttaja, aikuiskouluttaja ja koulutusviejä. Akateemiseen yhteisöömme kuuluu 15 000 perus- ja jatko-opiskelijaa 90 maasta, 20 000 aikuisopiskelijaa ja 2 500 työntekijää. Lisätietoja: [email protected] www.jyu.fi
© Koodiviidakko Oy - Y-tunnus 1939962-1